Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDRT15Q96T59 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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