Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RSF1Q96T23 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
RSF1Q96T23 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms