Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PANX3Q96QZ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PANX3Q96QZ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX3Q96QZ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms