Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC9Q96Q05 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms