Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3Q96PU9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3Q96PU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms