Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SORCS2Q96PQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SORCS2Q96PQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS2Q96PQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms