Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEUROD6Q96NK8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEUROD6Q96NK8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEUROD6Q96NK8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms