Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA13Q96N96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA13Q96N96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms