Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ROBO3Q96MS0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROBO3Q96MS0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROBO3Q96MS0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms