Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00479Q96M42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00479Q96M42 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms