Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf72Q96LT7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf72Q96LT7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms