Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms