Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CABS1Q96KC9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CABS1Q96KC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms