Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM87BQ96K49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87BQ96K49 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms