Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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