Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM46AQ96IP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FAM46AQ96IP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM46AQ96IP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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