Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RBM17Q96I25 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM17Q96I25 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM17Q96I25 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms