Protein–RNA interactions for Protein: Q96HQ2

CDKN2AIPNL, CDKN2AIP N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2AIPNLQ96HQ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPNLQ96HQ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms