Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms