Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALML4Q96GE6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALML4Q96GE6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms