Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39LQ96EH5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39LQ96EH5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms