Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELP4Q96EB1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELP4Q96EB1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms