Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTERF3Q96E29 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms