Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CMTM5Q96DZ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM5Q96DZ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms