Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP4Q96DX8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP4Q96DX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP4Q96DX8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms