Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms