Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHISA4Q96DD7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHISA4Q96DD7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms