Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP3Q96CW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBGCP3Q96CW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms