Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NSUN4Q96CB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN4Q96CB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms