Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms