Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SMARCE1Q969G3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms