Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX4Q969G2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms