Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRF1Q92994 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms