Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA6Q92908 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms