Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC4Q92889 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC4Q92889 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC4Q92889 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms