Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORBQ92753 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RORBQ92753 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORBQ92753 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORBQ92753 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORBQ92753 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORBQ92753 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RORBQ92753 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RORBQ92753 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RORBQ92753 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RORBQ92753 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RORBQ92753 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RORBQ92753 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RORBQ92753 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RORBQ92753 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RORBQ92753 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RORBQ92753 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RORBQ92753 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RORBQ92753 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RORBQ92753 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RORBQ92753 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RORBQ92753 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RORBQ92753 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms