Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABGGTAQ92696 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTAQ92696 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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RABGGTAQ92696 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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