Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGP1Q92546 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RGP1Q92546 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms