Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM9SF4Q92544 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF4Q92544 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms