Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM3CQ92520 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM3CQ92520 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM3CQ92520 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms