Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAAF4Q8WXU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAAF4Q8WXU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms