Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATAD2BQ8WXI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GATAD2BQ8WXI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms