Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PSPC1Q8WXF1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPC1Q8WXF1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSPC1Q8WXF1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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