Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms