Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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