Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBLCP1Q8WVY7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBLCP1Q8WVY7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBLCP1Q8WVY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms