Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX29Q8TEQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX29Q8TEQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms