Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms