Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTRT1Q8TDG2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTRT1Q8TDG2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms