Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX54Q8TDD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX54Q8TDD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX54Q8TDD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms