Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATL2Q8NHH9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL2Q8NHH9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL2Q8NHH9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms